住宅ローンランキング1位は住信SBIネット銀行です。最大の特徴は「ローン金利の安さ」と「手厚い保険」の二点です。ローン金利面は業界最安値ともいえるローン金利0.875%（変動。2011年11月）という水準が筆頭に挙げられます。次の保証という面は団信保険料が無料。さらに、独自の8大疾病に基づく就業不能まで無料で保障してくれるという点です。

ネットバンク系の住宅ローンの中でも最も人気のある住宅ローンで2012年1月6日には累計融資額が9500億円を突破しています。

マイナスポイントをあえて挙げるとするならば「ローン契約時の手数料2.1％はちょっと高い」「審査が少し厳しい」という2点でしょうか。ただ、審査は当然無料なので試してみる価値は十分にある銀行です。
>> 住信SBIネット銀行住宅ローン詳細

こんな特徴がある住宅ローンです。
・業界最安の住宅ローン金利
・充実した保険・保障制度がある

こんな人に向いている住宅ローンです。
・コストパフォーマンスよく住宅ローンを利用したい方
・ネットでのやり取りに抵抗が少ない方

住信SBIネット銀行
住信SBIネット銀行住宅ローン 公式ホームページ

新生銀行の住宅ローンは非常にバランスのとれた住宅ローサービスとなっています。ローン金利も安い上、手数料も50000円（税込）と他行と比べるとかなり安い水準です。また、保証料や繰上返済手数料は当然無料。

このほか、新生銀行に銀行口座を持っている方にはさらにお勧めのポイントとして住宅ローン利用者はすべて新生銀行における最上級の優遇である「プラチナ」となれる点です。これにより、他行への振込手数料が月10回まで無料、預金金利の優遇などの各種優遇サービスを利用できます。
逆に、すでに新生銀行でプラチナの会員の方は、住宅ローン事務手数料が無料（ゴールドの方は半額）となります。

ローン金利面では、住信SBIネット銀行にはおよびませんが、有人店舗によるサービスが欲しいという方はこちらの方がいいかも。
また、「スマート返済（新生銀行の口座に一定以上の資金があれば自動的に繰上返済するサービス）」や「生活貸越（過去の繰上返済の範囲内での貸付）」などのユニークなサービスも提供しています。
>>　新生銀行住宅ローン詳細

こんな特徴がある住宅ローンです。
・業界最安水準の住宅ローン金利
・万が一の場合の場合の「生活貸越」などのサービス
・通販型ではなく、ちゃんと店舗（支店）がある

こんな人に向いている住宅ローンです。
・新生銀行を預金口座として利用している方
（プラチナの方は事務手数料無料、ゴールドは半額）

新生銀行 住宅ローン
新生銀行住宅ローン公式ホームページ

住宅ローンランキング第2位は、順位大幅アップの「イオン銀行」です。

大きな特徴は業界最低水準の金利となる、固定1年金利が年0.60%（2012年1月）という水準。さらに住宅ローン利用者限定の特典、イオンセレクトクラブへの加入が挙げられます（イオンでのお買い物が常時5%offになる特典など）。

マイナスな点としては35年固定金利が提供されていないので、長期固定金利を利用はできないという点でしょうか。
>>イオン銀行の詳細を見る

こんな特徴がある住宅ローンです。
・業界最安水準の住宅ローン金利
・イオン利用者にお得な特典（イオンセレクトクラブ）

こんな人に向いている住宅ローンです。
・イオンでのお買い物を良くされる方

イオン銀行 住宅ローン
イオン銀行住宅ローン公式ホームページ

ランキング4位：ソニー銀行住宅ローン

ネット系住宅ローンサービスの中でも古くから住宅ローンを提供しているのが、ソニー銀行の住宅ローンです。変動金利・固定金利ともにかなり安く設定されているのが人気の秘密です。事務手数料も42000円と他の銀行と比較して安くなっています。

また、申し込みから契約まで、手続きはすべてインターネット上で完了します。全部ネットは心配という方にも担当のローンアドバイザーが相談、契約お手続きを最後までサポートしてくれます。

住信SBIネット銀行よりもやや金利は高いですが、フォロー面（担当者による相談など）は高い評価を受けています。
また、ソニー銀行住宅ローンは「固定金利」と「変動金利」の切替が任意にできるようになっています。住宅ローンの金利情勢に合わせてリスク対策ができるのも大きな魅力です。
>>ソニー銀行住宅ローン詳細

こんな特徴がある住宅ローンです。
・手続きはすべてネットで完結
・中古マンションにも利用できる
・固定⇔変動の金利変更OK

こんな人に向いている住宅ローンです。
・できるだけ低金利での住宅ローンを検討している方
・金利は下げたいが、住宅ローンについて相談もしたい方

ソニー銀行
ソニー銀行住宅ローン 公式ホームページ

ランキング5位：楽天銀行（フラット35）

楽天銀行のフラット35は金利&手数料の安さが特徴です。金利はもちろん、全フラット35提供業者の中で最安なのですが、さらに事務手数料も1.05％〜1.365%と安いのが特徴です。
※「楽天銀行」を返済口座にすることで、通常1.365%の事務手数料が1.05％に割引されます。

フラット35を使って住宅ローンを利用したいという方にとっては一番お勧めな住宅ローンサービスです。
>>楽天銀行住宅ローン詳細

こんな特徴がある住宅ローンです。
・フラット35利用ならもっともお勧め。

こんな人に向いている住宅ローンです。
・長期の住宅ローンを検討している方
・フラット35Sエコ・ベーシック適用物件の購入を検討している方

楽天銀行のフラット35
楽天銀行住宅ローン（フラット35） 公式ホームページ